Hvala na pitanju :) Studijski programi koje si naveo su veoma slični, pa i u praksi diplomci fitomedicine i agronomije najčešće rade zajedno. Istakla bih razliku u prijemnom ispitu, naime prijemni ispit na Poljoprivrednom fakultetu u Beogradu za bilo koji od smerova omogućava izbor polaganja jednog od pet predmeta (biologije, hemije, fizike, sociologije i matematike), dok se na Agronomskom fakultetu u Čačku za studijski program agronomije polaže biologija ili hemija. Takođe, na studijama fitomedicine u Beogradu se prima značajno više studenata na osnovne studije. I osnovne studije agronomije i fitomedicine traju 4 godine. Međutim, studije fitomedicine su više usmerene na temeljno izučavanje biljaka i studije su organizovane tako da zahtevaju učestvovanje na tri prakse tokom studija, dok su studije agronomije više usmerene na predmete koji se bave izučavanjem procesa u poljoprivredi (voćarstvo, povrtarstvo, stočarstvo i drugi...).

Opis zanimanja inženjera poljoprivrede možeš videti ovde, dok u odgovorima na prethodno postavljena pitanja možeš videti čime sve možeš da se baviš nakon studija fitomedicine (http://karijera.bos.rs/savetnica/986/fitomedicina.html) 

Na sledećim linkovima možeš videti studijske programe agronomije na Agronomskom fakultetu u Čačku i fitomedicine na Poljoprivrednom fakultetu u Beogradu kako bi mogao da se upoznaš sa njima i da ih uporediš u odnosu na ono što tebe više zanima. Vezano za nastavak master studija na studijama fitomedicine predlažem ti da kontaktiraš Poljoprivredni fakultet  (office@agrif.bg.ac.rs, 011 4413555) kako bi saznao koje su mogućnosti i uslovi upisa. U prošlogodišnjem konkursu za upis možeš saznati nešto malo više o tome - http://bg.ac.rs/files/sr/upis/master-akademske/PF-master-upis-2016.pdf.