U suštini, razlike nema. Razlika između diplomiranog farmaceuta i magistra farmacije jeste jedino u zvanju koje studenti dobijaju, odnosno koje su dobijali nakon završenih studija farmacije. Zvanje magistra farmacije sticali su studenti koji su završavali fakultet do 70-tih godina XX veka, da bi nakon toga zvanje bilo reformisano u diplomirani farmaceut. Danas, diplomske osnovne studije su od školske 2006/2007 godine zamenjene integrisanim akademskim studijama, nakon kojih se dobija zvanje magistra farmacije.